Ο Μασούρας είναι διάσημος για την υποστήριξη διαφόρων θεωριών συνωμοσίας σχετικά με τον αντισημιτισμό , τον COVID-19και τη Νέα Παγκόσμια Τάξη . Ο Μασούρας ήταν ανοιχτά κατά των εμβολίων κατά του COVID-19 και ενός από τα μέτρα για την πανδημία σε Ελλάδα και Κύπρογια αλλαγή ώρας της πομπής του Πάσχα από τις 12 το μεσημέρι σε 9 το βράδυ. [3] Υποστήριξε ότι οι Ορθόδοξοι πρέπει να προσπαθήσουν να αποφύγουν την ηλεκτρονική ταυτοποίησηκαι ότι ο ίδιος δεν έχει λάβει τέτοια ταυτότητα και θα προσπαθήσει να την καθυστερήσει όσο μπορεί. [4]
Ο Μασούρας είναι κατά του οικουμενισμού . Έχει πει ότι ο πόλεμος στην Ουκρανία συνέβη επειδή ο Θεός θέλει να καθαρίσει τον κόσμο από τους Μασόνουςκαι ότι ο Πούτιν θέλει να σταματήσει τη Νέα Παγκόσμια Τάξη. [5] [6] Ως εκ τούτου, δεν παρευρέθηκε στην επίσκεψη του Πάπα Φραγκίσκου στην Αρχιεπισκοπή Κύπρου. [7]
Σε διάφορα υπουργεία και ανατολικές ορθόδοξες λειτουργίες, ο Μασούρας έπεισε τους ανθρώπους να μην φορούν μάσκες ή να ακολουθούν μέτρα κατά του COVID καθώς υποστήριξε ότι είναι «σατανικές» και δεν είναι ωφέλιμες. Παρά τις εντολές της κυβέρνησης να μην παρευρεθεί σε τέτοιες εκδηλώσεις στην πανδημία, ο Μασούρας παραβίασε τις εντολές και προχώρησε κανονικά στην εκδήλωση της Κυριακής των Βαΐων στην εκκλησία του όπου τελικά συνελήφθη μετά από έλεγχο της αστυνομίας για να διαπιστωθεί εάν συμμορφωνόταν με τα μέτρα. [8]

Τον Ιούλιο του 2019 αντιδράσεις προκάλεσαν οι απόψεις του για την συσχέτιση της ομοφυλοφιλίας με το πρωκτικό σεξ κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης. [5] [6] [7] Ο ίδιος ανέφερε ότι μετέφερε απλά τα λόγια του Αγίου Πορφυρίου. Ο αρχηγός της Κυπριακής Αστυνομίας, διέταξε τον Αύγουστο την άμεση διερεύνηση της υπόθεσης των δηλώσεων.[8]Στο πόρισμα της Αστυνομίας που ανακοινώθηκε τον Σεπτέμβριο του ίδιου έτους δεν διαπιστώθηκε διάπραξη ποινικού αδικήματος.[9]
Το 2020, αντιτάχθηκε στην αναγνώριση της αυτοκεφαλίαςτης Ορθόδοξης Εκκλησίας της Ουκρανίας, καταψηφίζοντας σχετική πρόταση στην Ιερά Σύνοδο.[10] Σε προηγούμενες δηλώσεις του είχε υποστηρίξει ότι αναγνωρίζει ως κανονικό προκαθήμενο τον μητροπολίτη Κιέβου Ονούφριο της Ουκρανικής Ορθόδοξης Εκκλησίας (Πατριαρχείο Μόσχας).[11]
Τον Ιούνιο του 2021 η Εκκλησία της Ελλάδος, δια του Αρχιεπισκόπου Αθηνών Ιερώνυμου, έστειλε επιστολή προς τον Αρχιεπίσκοπο Κύπρου και διαμαρτυρήθηκε για τις θέσεις του Νεόφυτου απέναντι στην πανδημία του κορονοϊούθεωρώντας πως όσα λέει επηρεάζουν και παρασύρουν το ποίμνιο της Εκκλησίας της Ελλάδας.[12]
Τον Ιανουάριο του 2023 δεν παρέστη στην ενθρόνιση του νέου Αρχιεπισκόπου Κύπρου Γεωργίου, λόγω της διαφωνίας του σχετικά με την αναγνώριση της Ορθόδοξης Εκκλησίας της Ουκρανίας, και της παρουσίας εκπροσώπων της στην τελετή.